RTO焚烧炉的运行原理是把有机废气加热到760摄氏度（具体要分析成分）之上，使废气中的VOC在氧化分解成二氧化碳和水，氧化产生的高温气体流经特制的陶瓷蓄热体，使陶瓷体升温而“蓄热”，此“蓄热”用于预热后续进入的有机废气。这样可节省废气升温的燃料消耗，陶瓷蓄热室应分成两个（含两个）以上，每个蓄热室依次经历蓄热、放热、清扫等程序，周而复始，连续工作。蓄热室“放热”后应立即引入适量洁净空气对该蓄热室进行清扫，只有待清扫完成后才能进入“蓄热”程序，否则残留的VOCS随烟气排放到烟囱从而降低处理效率。